“平行反应监测”（Parallel Reaction Monitoring，PRM）是一种基于高分辨率质谱仪的靶向定量蛋白质组学技术，近年来在蛋白质功能研究、生物标志物验证及复杂样本背景中的靶向定量分析中得到了广泛应用。与多反应监测（MRM）技术相比，PRM在特异性、分辨率及抗干扰能力方面具有显著优势，适用于对目标肽段的高精度定量需求。

本文将从平行反应监测PRM的原理机制、实验流程、技术优势与典型应用场景四个方面进行全面解析，并介绍百泰派克生物科技在PRM蛋白质组服务方面的技术特色。

一、平行反应监测PRM的原理：精准识别目标肽段的“多维快照”

1、技术核心：全产物离子并行采集 + 高分辨精确质量数检测

PRM基于高分辨率、高精度的质谱仪（如Orbitrap或Q-TOF），对目标肽段的前体离子进行选择性碎裂，并并行采集所有产物离子信号。与MRM依赖特定离子对（transition）的方式不同，PRM可以在一次分析中获取完整的产物离子谱图，增强了数据的特异性和结果的可靠性。

这种“全谱段采集”方式使得PRM在复杂样本背景中具有更强的抗干扰能力，尤其适用于难以预测离子干扰的研究场景。

2、PRM vs. MRM：对比总结

二、平行反应监测PRM工作流程：从靶点设计到定量分析

1、靶点筛选与肽段设计

（1）来源于DDA或DIA发现阶段、文献或数据库（如PeptideAtlas、SRMAtlas）

（2）选择具有：

• 唯一性（代表性肽段）
• 良好离子化效率
• 易裂解产生稳定产物离子的肽段

2、标准品选择（可选）

（1）可添加稳定同位素标记肽（SIS）用于绝对定量

（2）内标肽用于校正样本处理及质谱漂移误差

3、样本处理

通常为：蛋白提取 → 胰蛋白酶酶解 → 净化 → 加入内标 → 上机分析

4、质谱分析（Orbitrap PRM）

（1）使用高分辨率质谱仪（如Thermo Orbitrap Exploris）

（2）设定目标肽段的前体m/z，自动采集全产物离子谱

（3）获取高分辨率、高特异性的色谱峰图谱

5、数据处理

（1）主要使用 Skyline 软件

（2）通过多条产物离子的保留时间、峰型、一致性等进行验证和定量

（3）可输出相对定量/绝对定量结果

三、PRM的技术优势

1、高特异性

• 基于全产物谱图+高分辨率，极大降低假阳性率
• 适合检测低丰度蛋白或在高背景复杂基质（如血浆、尿液）中定量

2、灵活性高

只需设定目标前体离子，所有碎片离子信息保留，便于后续挖掘和方法优化

3、无需开发Transition列表

与MRM相比，PRM不需繁琐的离子筛选流程，方法开发周期短

4、可与DIA互补

PRM适合做验证实验，而DIA适合发现，二者联用可形成高效验证闭环

四、PRM的典型应用场景

1、生物标志物验证

PRM常用于DDA或DIA筛选后靶点的验证，适用于对表达差异显著蛋白进行二次定量确认。

2、复杂样本中的靶点定量分析

在血浆、尿液、脑脊液等复杂生物样本中，PRM能够提供更高的特异性，有助于提升数据质量。

3、药效学与时间曲线研究

用于评价药物处理前后关键通路蛋白的动态表达。

4、合成生物学调控节点定量

精准量化代谢通路中关键酶表达水平，辅助调控策略设计。

百泰派克生物科技：PRM定量蛋白质组服务优势

百泰派克生物科技在PRM平台建设与技术服务方面，具备如下优势：

• 高分辨PRM平台：配备Thermo Orbitrap Exploris 480质谱系统
• 标准化流程控制：样本处理-肽段筛选-内标引入-数据分析全流程标准化
• 支持内标绝对定量：合成稳定同位素肽，适配临床验证需求
• 可与DIA数据整合：为您的“发现→验证→转化”提供一站式解决方案

平行反应监测（PRM）是一种融合高分辨率质谱优势的靶向定量策略，兼具高灵敏、高特异与高稳定性，尤其适合于靶标蛋白验证与低丰度蛋白定量。其在生物标志物验证、临床研究和复杂样本分析中的价值不断显现。通过合理设计靶点、优化方法开发流程，并结合高性能平台，科研人员可以更稳定、准确地实现蛋白定量目标。百泰派克生物科技致力于为您提供高质量、可信赖的PRM定量解决方案，助力精准科研与转化应用的稳步推进。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

>>点击了解更多优质服务项目